Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTG1P63261 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTG1P63261 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTG1P63261 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms