Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERV-K104P61576 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERV-K104P61576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERV-K104P61576 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms