Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRP54P61011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP54P61011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP54P61011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP54P61011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP54P61011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP54P61011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP54P61011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP54P61011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP54P61011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP54P61011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP54P61011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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