Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFNA5P52803 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFNA5P52803 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFNA5P52803 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFNA5P52803 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFNA5P52803 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFNA5P52803 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EFNA5P52803 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFNA5P52803 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFNA5P52803 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EFNA5P52803 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms