Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKXP51817 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKXP51817 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKXP51817 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKXP51817 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKXP51817 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKXP51817 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKXP51817 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKXP51817 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKXP51817 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKXP51817 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKXP51817 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKXP51817 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKXP51817 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKXP51817 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKXP51817 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKXP51817 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKXP51817 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKXP51817 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKXP51817 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKXP51817 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKXP51817 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKXP51817 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKXP51817 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKXP51817 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKXP51817 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKXP51817 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKXP51817 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKXP51817 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKXP51817 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKXP51817 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKXP51817 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKXP51817 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKXP51817 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKXP51817 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKXP51817 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKXP51817 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKXP51817 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKXP51817 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKXP51817 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKXP51817 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKXP51817 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKXP51817 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKXP51817 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKXP51817 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKXP51817 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKXP51817 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKXP51817 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKXP51817 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKXP51817 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKXP51817 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKXP51817 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKXP51817 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKXP51817 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKXP51817 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKXP51817 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKXP51817 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKXP51817 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKXP51817 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKXP51817 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKXP51817 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKXP51817 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKXP51817 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKXP51817 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKXP51817 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKXP51817 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKXP51817 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKXP51817 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms