Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD8P48556 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD8P48556 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD8P48556 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMD8P48556 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD8P48556 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms