Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX9P48436 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX9P48436 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX9P48436 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX9P48436 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX9P48436 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX9P48436 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX9P48436 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX9P48436 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX9P48436 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX9P48436 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX9P48436 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX9P48436 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX9P48436 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX9P48436 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX9P48436 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX9P48436 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX9P48436 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX9P48436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX9P48436 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX9P48436 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX9P48436 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX9P48436 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX9P48436 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX9P48436 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX9P48436 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX9P48436 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX9P48436 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX9P48436 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX9P48436 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX9P48436 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX9P48436 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX9P48436 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX9P48436 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX9P48436 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX9P48436 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX9P48436 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX9P48436 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX9P48436 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX9P48436 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX9P48436 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX9P48436 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX9P48436 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX9P48436 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX9P48436 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX9P48436 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX9P48436 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX9P48436 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX9P48436 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOX9P48436 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX9P48436 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX9P48436 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX9P48436 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX9P48436 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX9P48436 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX9P48436 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX9P48436 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX9P48436 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX9P48436 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX9P48436 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX9P48436 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX9P48436 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX9P48436 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX9P48436 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX9P48436 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX9P48436 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX9P48436 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX9P48436 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX9P48436 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX9P48436 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX9P48436 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX9P48436 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX9P48436 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX9P48436 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX9P48436 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX9P48436 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX9P48436 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX9P48436 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX9P48436 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX9P48436 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX9P48436 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms