Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RANGAP1P46060 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
RANGAP1P46060 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RANGAP1P46060 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RANGAP1P46060 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RANGAP1P46060 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
RANGAP1P46060 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
RANGAP1P46060 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RANGAP1P46060 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
RANGAP1P46060 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
RANGAP1P46060 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms