Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAGEA1P43355 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAGEA1P43355 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MAGEA1P43355 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEA1P43355 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEA1P43355 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEA1P43355 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEA1P43355 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEA1P43355 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MAGEA1P43355 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEA1P43355 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEA1P43355 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEA1P43355 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAGEA1P43355 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAGEA1P43355 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAGEA1P43355 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEA1P43355 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEA1P43355 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEA1P43355 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MAGEA1P43355 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAGEA1P43355 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms