Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP2P42575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP2P42575 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP2P42575 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP2P42575 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP2P42575 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP2P42575 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP2P42575 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP2P42575 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP2P42575 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP2P42575 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP2P42575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP2P42575 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP2P42575 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP2P42575 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP2P42575 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP2P42575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP2P42575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP2P42575 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP2P42575 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP2P42575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP2P42575 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP2P42575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP2P42575 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP2P42575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP2P42575 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP2P42575 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP2P42575 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP2P42575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP2P42575 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP2P42575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP2P42575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP2P42575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP2P42575 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP2P42575 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP2P42575 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP2P42575 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP2P42575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP2P42575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP2P42575 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP2P42575 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP2P42575 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP2P42575 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP2P42575 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP2P42575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP2P42575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP2P42575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP2P42575 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP2P42575 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP2P42575 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP2P42575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP2P42575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP2P42575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP2P42575 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP2P42575 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP2P42575 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP2P42575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP2P42575 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP2P42575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP2P42575 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP2P42575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP2P42575 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP2P42575 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP2P42575 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP2P42575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms