Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2IP36954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2IP36954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2IP36954 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2IP36954 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms