Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC13P31276 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC13P31276 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC13P31276 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC13P31276 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms