Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRR2P28476 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRR2P28476 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRR2P28476 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRR2P28476 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GABRR2P28476 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABRR2P28476 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms