Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLNP26678 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLNP26678 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLNP26678 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLNP26678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLNP26678 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLNP26678 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLNP26678 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLNP26678 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLNP26678 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLNP26678 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLNP26678 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLNP26678 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLNP26678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLNP26678 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLNP26678 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLNP26678 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLNP26678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLNP26678 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLNP26678 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLNP26678 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLNP26678 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLNP26678 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLNP26678 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLNP26678 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLNP26678 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLNP26678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLNP26678 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLNP26678 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLNP26678 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLNP26678 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLNP26678 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLNP26678 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLNP26678 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLNP26678 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLNP26678 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLNP26678 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLNP26678 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLNP26678 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLNP26678 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLNP26678 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLNP26678 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLNP26678 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLNP26678 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLNP26678 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLNP26678 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLNP26678 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLNP26678 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLNP26678 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms