Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPAP23025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XPAP23025 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XPAP23025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPAP23025 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPAP23025 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPAP23025 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPAP23025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPAP23025 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPAP23025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPAP23025 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPAP23025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPAP23025 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPAP23025 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPAP23025 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPAP23025 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPAP23025 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPAP23025 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPAP23025 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPAP23025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPAP23025 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPAP23025 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XPAP23025 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPAP23025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPAP23025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPAP23025 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPAP23025 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XPAP23025 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPAP23025 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XPAP23025 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XPAP23025 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPAP23025 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPAP23025 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XPAP23025 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPAP23025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XPAP23025 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPAP23025 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPAP23025 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPAP23025 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPAP23025 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XPAP23025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPAP23025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPAP23025 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPAP23025 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPAP23025 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XPAP23025 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPAP23025 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPAP23025 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPAP23025 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPAP23025 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPAP23025 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPAP23025 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPAP23025 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPAP23025 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPAP23025 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPAP23025 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XPAP23025 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPAP23025 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPAP23025 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPAP23025 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XPAP23025 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPAP23025 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms