Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB1P20618 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB1P20618 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB1P20618 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB1P20618 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms