Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRM3P20309 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRM3P20309 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRM3P20309 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM3P20309 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM3P20309 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms