Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFEBP19484 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFEBP19484 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFEBP19484 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFEBP19484 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFEBP19484 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFEBP19484 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFEBP19484 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFEBP19484 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TFEBP19484 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFEBP19484 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFEBP19484 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFEBP19484 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFEBP19484 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFEBP19484 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFEBP19484 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFEBP19484 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFEBP19484 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFEBP19484 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFEBP19484 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFEBP19484 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFEBP19484 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFEBP19484 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFEBP19484 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFEBP19484 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFEBP19484 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFEBP19484 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFEBP19484 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFEBP19484 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFEBP19484 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFEBP19484 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFEBP19484 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TFEBP19484 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFEBP19484 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFEBP19484 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFEBP19484 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFEBP19484 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFEBP19484 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFEBP19484 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TFEBP19484 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TFEBP19484 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFEBP19484 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFEBP19484 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFEBP19484 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFEBP19484 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFEBP19484 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFEBP19484 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFEBP19484 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFEBP19484 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFEBP19484 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFEBP19484 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFEBP19484 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFEBP19484 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFEBP19484 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFEBP19484 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFEBP19484 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFEBP19484 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFEBP19484 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFEBP19484 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFEBP19484 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFEBP19484 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFEBP19484 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFEBP19484 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFEBP19484 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFEBP19484 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFEBP19484 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFEBP19484 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TFEBP19484 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms