Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC3P19447 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC3P19447 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC3P19447 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC3P19447 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC3P19447 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC3P19447 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms