Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRB1P17538 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB1P17538 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB1P17538 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB1P17538 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB1P17538 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB1P17538 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB1P17538 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB1P17538 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB1P17538 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB1P17538 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB1P17538 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRB1P17538 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB1P17538 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB1P17538 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB1P17538 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB1P17538 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB1P17538 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB1P17538 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB1P17538 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB1P17538 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB1P17538 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB1P17538 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTRB1P17538 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB1P17538 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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