Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATA1P15976 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATA1P15976 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATA1P15976 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATA1P15976 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GATA1P15976 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATA1P15976 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATA1P15976 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATA1P15976 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATA1P15976 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATA1P15976 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATA1P15976 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATA1P15976 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATA1P15976 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATA1P15976 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATA1P15976 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATA1P15976 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATA1P15976 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATA1P15976 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GATA1P15976 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATA1P15976 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATA1P15976 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATA1P15976 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATA1P15976 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATA1P15976 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATA1P15976 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATA1P15976 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATA1P15976 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATA1P15976 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATA1P15976 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATA1P15976 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATA1P15976 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATA1P15976 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATA1P15976 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATA1P15976 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATA1P15976 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GATA1P15976 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATA1P15976 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATA1P15976 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GATA1P15976 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATA1P15976 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATA1P15976 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATA1P15976 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATA1P15976 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATA1P15976 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATA1P15976 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATA1P15976 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATA1P15976 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATA1P15976 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATA1P15976 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATA1P15976 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATA1P15976 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms