Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB3P14651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB3P14651 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB3P14651 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXB3P14651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms