Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
IFITM1P13164 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM1P13164 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms