Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR2C1P13056 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR2C1P13056 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2C1P13056 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2C1P13056 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms