Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB3P10600 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB3P10600 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TGFB3P10600 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGFB3P10600 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGFB3P10600 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms