Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR23D2P0DMB1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR23D2P0DMB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR23D2P0DMB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms