Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PNMA6AP0CW24 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA6AP0CW24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA6AP0CW24 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PNMA6AP0CW24 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA6AP0CW24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA6AP0CW24 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.6 ms