Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC172P0C7W6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC172P0C7W6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC172P0C7W6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC172P0C7W6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC172P0C7W6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC172P0C7W6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms