Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROS1P08922 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROS1P08922 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROS1P08922 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROS1P08922 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROS1P08922 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROS1P08922 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROS1P08922 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROS1P08922 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROS1P08922 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROS1P08922 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROS1P08922 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROS1P08922 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROS1P08922 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROS1P08922 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROS1P08922 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROS1P08922 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROS1P08922 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROS1P08922 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROS1P08922 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROS1P08922 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROS1P08922 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROS1P08922 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROS1P08922 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ROS1P08922 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROS1P08922 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROS1P08922 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROS1P08922 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROS1P08922 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROS1P08922 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROS1P08922 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROS1P08922 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROS1P08922 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROS1P08922 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROS1P08922 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROS1P08922 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROS1P08922 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROS1P08922 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROS1P08922 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROS1P08922 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROS1P08922 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROS1P08922 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROS1P08922 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROS1P08922 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ROS1P08922 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROS1P08922 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROS1P08922 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROS1P08922 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROS1P08922 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROS1P08922 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROS1P08922 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROS1P08922 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ROS1P08922 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROS1P08922 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROS1P08922 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ROS1P08922 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROS1P08922 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ROS1P08922 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROS1P08922 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ROS1P08922 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROS1P08922 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROS1P08922 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROS1P08922 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROS1P08922 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROS1P08922 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROS1P08922 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROS1P08922 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROS1P08922 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms