Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA5P08648 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA5P08648 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGA5P08648 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms