Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GP1BAP07359 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GP1BAP07359 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GP1BAP07359 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GP1BAP07359 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GP1BAP07359 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GP1BAP07359 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GP1BAP07359 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GP1BAP07359 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GP1BAP07359 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GP1BAP07359 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GP1BAP07359 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GP1BAP07359 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms