Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFNA4P05014 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFNA4P05014 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFNA4P05014 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFNA4P05014 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms