Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB4AP04350 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4AP04350 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4AP04350 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB4AP04350 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB4AP04350 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB4AP04350 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms