Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAF1P04049 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAF1P04049 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAF1P04049 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAF1P04049 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAF1P04049 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAF1P04049 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAF1P04049 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAF1P04049 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAF1P04049 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAF1P04049 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAF1P04049 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAF1P04049 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAF1P04049 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAF1P04049 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAF1P04049 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAF1P04049 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAF1P04049 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAF1P04049 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAF1P04049 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAF1P04049 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAF1P04049 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAF1P04049 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAF1P04049 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAF1P04049 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAF1P04049 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAF1P04049 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAF1P04049 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAF1P04049 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAF1P04049 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAF1P04049 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAF1P04049 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAF1P04049 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAF1P04049 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAF1P04049 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAF1P04049 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAF1P04049 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAF1P04049 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAF1P04049 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAF1P04049 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAF1P04049 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAF1P04049 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAF1P04049 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAF1P04049 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAF1P04049 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAF1P04049 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAF1P04049 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAF1P04049 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAF1P04049 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAF1P04049 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAF1P04049 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAF1P04049 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAF1P04049 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAF1P04049 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAF1P04049 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAF1P04049 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAF1P04049 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms