Protein–RNA interactions for Protein: O95872

GPANK1, G patch domain and ankyrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPANK1O95872 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPANK1O95872 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPANK1O95872 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPANK1O95872 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms