Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN9O95484 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN9O95484 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN9O95484 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms