Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms