Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFPL2O75678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFPL2O75678 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFPL2O75678 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFPL2O75678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFPL2O75678 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFPL2O75678 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFPL2O75678 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFPL2O75678 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFPL2O75678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFPL2O75678 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFPL2O75678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms