Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE3O75131 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE3O75131 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE3O75131 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPNE3O75131 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms