Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL41O60662 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL41O60662 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL41O60662 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL41O60662 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms