Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3O43617 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC3O43617 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3O43617 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3O43617 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms