Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A1O15245 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A1O15245 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC22A1O15245 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A1O15245 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms