Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFDN6O15212 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PFDN6O15212 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN6O15212 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PFDN6O15212 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms