Protein–RNA interactions for Protein: O15085

ARHGEF11, Rho guanine nucleotide exchange factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF11O15085 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ARHGEF11O15085 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARHGEF11O15085 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ARHGEF11O15085 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGEF11O15085 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ARHGEF11O15085 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ARHGEF11O15085 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ARHGEF11O15085 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF11O15085 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ARHGEF11O15085 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARHGEF11O15085 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
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