Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLOD2O00469 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLOD2O00469 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD2O00469 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD2O00469 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms