Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLRMTO00411 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLRMTO00411 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLRMTO00411 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
POLRMTO00411 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
POLRMTO00411 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLRMTO00411 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
POLRMTO00411 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms