Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QQQ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QQQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QQQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QQQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QQQ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QQQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QQQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QQQ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QQQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QQQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QQQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QQQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QQQ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QQQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QQQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QQQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QQQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QQQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3QQQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3QQQ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QQQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QQQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QQQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QQQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QQQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QQQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QQQ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QQQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QQQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QQQ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QQQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QQQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QQQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QQQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QQQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QQQ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QQQ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QQQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QQQ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QQQ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QQQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QQQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QQQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QQQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QQQ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QQQ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QQQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QQQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QQQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QQQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QQQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QQQ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QQQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QQQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QQQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms