Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CROCC2H7BZ55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CROCC2H7BZ55 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CROCC2H7BZ55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CROCC2H7BZ55 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CROCC2H7BZ55 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CROCC2H7BZ55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CROCC2H7BZ55 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms