Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PP2D1A8MPX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PP2D1A8MPX8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PP2D1A8MPX8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PP2D1A8MPX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PP2D1A8MPX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PP2D1A8MPX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PP2D1A8MPX8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PP2D1A8MPX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms