Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C5orf60A6NFR6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf60A6NFR6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C5orf60A6NFR6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C5orf60A6NFR6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms